Der Wettbewerbsnachteil von Biodiesel gegenüber konventionellem Diesel ist nach jüngsten Berechnungen der Union zur Förderung von Oel- und Proteinpflanzen e. V. (UFOP) auch weiterhin erheblich. In ihrer aktualisierten Übersicht zur Unterkompensation, in denen die Zahlen für Januar und Februar 2009 einbezogen sind, ergibt sich eine Benachteiligung in Höhe von 0,20 EUR je Liter.

Die Kosten für einen Liter Biodiesel summieren sich laut UFOP inklusive Energiesteuer von 21 Cent auf 1,08 Euro je Liter. Diesel kostet dagegen 88 Cent je Liter. Von Juli bis Dezember 2008 lag die Benachteilung noch bei 14 Cent je Liter. Zwar lagen in dem Zeitraum die Kosten für Pflanzenöl mit 74 Cent je Liter rund 20 Cent höher als heute. Dafür betrug die Energiesteuer im Jahr 2008 nur 15 Cent je Liter.