Die Mortellarosche Krankheit lässt sich in fünf Stadien unterteilen. Die individuelle Behandlung sollte sich daran orientieren. Neben gesund erscheinender Haut im Zwischenklauen- und Fesselbereich (M0-Stadium) können kleinere, noch oberflächlich erscheinende Einkerbungen vor allem auf der Zwischenklauenhaut und am Ballenrand auf die Infektion mit den Krankheitserregern hinweisen (M1-Stadium).

Das aufblühende M2-Stadium ist gekennzeichnet durch Haarverlust, geschwürig veränderte, offene Oberflächen, die kraterförmig oder wuchernd erscheinen. Bei Berührung sind die Läsionen meist schmerzhaft.

M3-Stadien sind Läsionen in Abheilung, dies sieht man vorübergehend am häufigsten nach einer Behandlung. Die Oberfläche ist dann mit einer dunklen Kruste überzogen. Oftmals gehen M3-Stadien auch in chronische Stadien über.

Im M4-Stadien lassen sich warzenartig wuchernde, chronische Veränderungen feststellen. Die akute Entzündung ruht. Oft ist der Übergang zum neuen Aufflammen fließend. Die Läsion geht über das M4.1 Stadium wieder ins M2-Stadium über.