Nach Angaben der Qualität und Sicherheit GmbH (QS) haben die zugelassenen, unabhängigen Zertifizierungsstellen im letzten Jahr über 1,1 Mio. QS-Kriterien geprüft. Dafür führten sie insgesamt 38 600 Kontrollen durch. In lediglich 1,5% dieser Audits konnte Betrieben keine Zulassung zum QS-System erteilt werden. In 189 Fällen leitete QS ein Sanktionsverfahren wegen Systemverstößen ein.
Im Einzelnen prüften die Zertifizierungsstellen bei Fleisch und Fleischwaren 2007 mehr als 970 000 QS-Kriterien in 31 800 Kontrollen. In lediglich 1,3% der Fälle konnte laut QS keine Zulassung zum QS-System erteilt werden. Rund 71% aller Audits betrafen die Stufe Landwirtschaft im Bereich Fleisch und Fleischwaren. Nur 0,7% der landwirtschaftlichen Betriebe erhielten keine Zulassung zum QS-System. In 92 Fällen wurde ein Sanktionsverfahren gegen landwirtschaftliche Betriebe eingeleitet. Es traten Verstöße gegen die Dokumentationspflichten und Anforderungen hinsichtlich Tiergesundheit und -schutz auf. So wurde am häufigsten gegen die verbotene Anbindehaltung von Sauen verstoßen. Die weiteren Fälle bezogen sich mehrheitlich auf fehlende Bestandsregister oder Herkunftsnachweise für Ferkel. Im Bereich Obst, Gemüse und Kartoffeln führten die Zertifizierer rund 6 800 Kontrollen durch. Auch hier erhielten nur 0,7% der landwirtschaftlichen Erzeugerbetriebe keine Systemzulassung. In 14 Betrieben waren Rückstandshöchstmengenüberschreitungen Anlass zur Sanktionierung. Nicht zugelassene Wirkstoffe fanden die Kontrolleure 13-mal. Insgesamt 17 Betriebe verstießen gegen beide Kriterien.